Академия «Зенита» располагает развитой инфраструктурой и методической базой, однако её воспитанники не закрепляются в основном составе петербургской команды.
Главное здание академии находится на улице Верности, 21 в Санкт-Петербурге. К 55-летию школы там открыли историческую экспозицию. Переход на двухразовые тренировки позволил сократить отставание по числу тренировочных часов от Академии «Краснодара».
«Зенит» также расширяет влияние на детско-юношеский футбол Санкт-Петербурга. При этом аренды отдельных игроков не всегда приводят к их возвращению в основную команду, а часть перспективных воспитанников выбирает другие варианты продолжения карьеры или уходит из футбола.
Среди упомянутых игроков — нападающий «Алмаз-Антея» Грачев 2009 года рождения. Александр Смольников, выступавший за команду Академии «Зенита» 2012 года рождения, уезжал за рубеж и не играет в первенстве Санкт-Петербурга.
